1 除非邓在论文里强调他的call rate阈值是93%,这一条来攻击他也够呛. 以前affymetrix genotyping console(GTC) 的default是call rate 86%.
2 性别是很容易从gene data里准确估计的,除非只有常染色体上的数据.
3 sample size 1000 不算大也不算小,第一个成功的GWAS study只有146个sample, 这要看位点的minor allele frequency(MAF), effect size等因素.如果MAF很小且effect size不大,他们的结果才很可疑.