◇◇新语丝(www.xys.org)(xys.dxiong.com)(xys.3322.org)(xys.xlogit.com)◇◇   读方先生评论的感想兼答部分网友   一只海龟   读了方先生关于川大两个新闻发布会的评论,虽然我对“评论”中的部分内 容有保留意见,但我觉得其中确实有很多值得川大和魏教授注意的地方。   从魏教授能多次回复网上的质疑以及主动提出举办“答辩会”等,应该说已 是很大的进步(谁让我们国内起点这么低)。但最重要一点是如何让“答辩会” 或“调查组”的结论能被绝大多数人接受?否则,川大和魏教授再辛苦也是白费。 虽然这类事在美国(包括最近在韩国)都是由当事人所在的大学主持,但在目前 的中国,公众对“由当事人所在大学主持调查”的方式存有疑虑是很正常(也很 有根据)的。相信川大和魏教授也一定明白,这事若现在没有令人信服的结论, 那么川大和魏教授今后都不再会有机会来证明你们的清白。你们也说过:希望由 上级部门来主持调查。我很赞同方先生说的“中科院或基金委”能出面主持。另 外,就一些细节的事说说我的建议(部分是方先生的内容,借用一下),供你们 参考:1. 裁判(专家)最重要,能否请几位国内和海外人士(可考虑由司和魏 各请1-2位,再由方先生请2-3位);2. 应该公布专家的名字;3. 应该请司教 授到场,川大也应该支付司教授的旅费(因司教授原已安排赴美探亲)和在成都 的费用;4. 在相关程序上,能否多征求一些其他人(包括方舟子)的意见。说 到这,我想多讲几句对方先生的看法。其实在对待这件事上,我自己对方先生也 有不同意见。但有一点,我们都应该相信方先生所做的一切是为了规范国内的科 研氛围,对维护和提高国内(包括川大)的学术声誉是很有益处的。尽管在新语 丝上有些帖子并不很专业,但更多的专业人士(尽管不发帖子)一直是它的忠实 读者,说明大家(包括专业人士)都认可和钦佩方先生的努力。希望川大和魏教 授能与方先生沟通,让这事有个令人信服的结论。只要能公正的处理这件事(不 管结论是:清白,还是造假),对川大的名声均有好处。   昨天,有几位网友回复了我的帖子。我希望这几位网友能再仔细读一下“我 对司教授的困惑”,仁者见仁,智者见智,自然可以得出你们自己的判断。司教 授的第一篇帖子,虽然在理论和行文方面有些问题,但基本上还就事论事。但最 近的几篇帖子,明显有许多不理性和误导普通读者的痕迹。至于为何提到司教授 的学生王院长,其实并不复杂。司教授是国内知名的免疫病理和肿瘤免疫专家, 又是基金委二审专家,我每年在写基金申请前一般总要看看这些专家的综述,希 望从中得到一些启发和教训。因此,就看了司教授2005年的专家述评,发现其参 考文献大多是司和王合作的论文,其中有王的一篇Cancer Research文章,再一 搜索,自然就了解到王院长的科研和事迹。我一直认为:评价别人的工作,特别 是指控别人“造假”,需要有一定的专业知识和solid evidence。特别是:司教 授说自己也重复了别人的实验,但未能得到相同的结果,并将此作为“指控”的 依据之一。那么我们是否首先应该想是什么原因导致结果不一致?究竟是模型不 同?实验技术不同?还是本身科学问题的复杂性?另外,很重要一点,自己的水 平如何?说句不敬的话,王院长在美国较短时间内能做出Cancer Research的文 章,但您回国后与司教授合作十几年,又有资源(院长)和多个基金,但你们的 实验室却很少(或没有?)有象样的文章发表,这说明什么问题?重复不了别人 的实验,或做的没别人好应该属于正常现象。所得到的不同结果也只能作为学术 讨论的subject而不能成为指控别人“造假”的依据。在同一述评中,司教授也 提到“数十年来经过共同努力,我们虽然备尝艰辛,确有一点成绩,但由于种种 客观和主观原因,眼看美国的HPv16预防性疫苗已经进入临床试验,而我们自己 独立研制的有知识产权的成果却得不到转化…,这一问题不能不引起我们的深 思”。我个人理解:这“深思”应该是深思我们为何没能做出“类似疫苗”的原 因,而不能说我们都没做出来,他们一定是造假,除此之外绝无第二种可能。   我很佩服司教授的勇气,我们也应该保护“打假者”,尤其是在国内目前的 环境下。这也是我最初两个帖子并没有说出我对司教授疑虑的原因。我们可以理 解“打假者”的自我保护,但“打假者”同样也需要诚实才能对得起广大网友对 您的支持。有网友说我“咬文嚼字”,那我就说的更直接一些,“我的困惑”中 至少有一部分是对司教授的诚信有疑虑,其中第一至第五点有专业内容,解释较 麻烦就暂略。但最后一点,大家一定看得懂,司教授先说这封公开信去年寄了, 后来又说没寄(不可能这两者都是事实吧);您后来又说没寄的理由,您不觉得 过于勉强?说实话,我是不相信您说的理由是truth。   正如很多网友所说的,广大关心此事的网友都不愿意自己的智商受到嘲弄。 “打假”是必需的,不仅是今天,将来也一样需要。司教授一会抛出一个帖子, 大家跟着愤怒一阵,如此多次,我们最终都会“脱敏”。特别是,若万一最终搞 错了,恐怕广大网友今后对类似的事件将难以再有激情。那么,若明天另有一位 “师”教授或“石”教授揭发另一位“卫”教授造假(可能是真的做假),网友 可能也会说:“别逗了,你想换件马甲又来折腾我们的智商和感情?”,因此无 动于衷。那样,才是可怕的结果。   总之,我希望:第一川大和老魏能让调查程序透明并得到大部分人的认可; 第二,希望各位网友把目标集中在如何推进调查和事实真相上,而不要被误导。   2006年4月18日   PS:方先生,不知昨天新语丝上的Western Blot图是否真的是司教授发给您 的?我怀疑会不会是“魏于全的支持者们”用来故意“诬蔑”司教授?因为,从 这张图上得出的结果非但不能成为任何指控“魏”作假的证据,反而有点象是支 持魏于全的论文?第一,该免疫血清也只能检测到几个条带(而不是对更多异种 抗原的应答),与老魏的相似(当然,分子量不同,技术原因见下述);第二, 这个图的总体质量很差,而且有明显的剪接和拼凑痕迹(应该不会是图片压缩造 成的);第三,就是这样一张剪接的而且只有三条样品带的图,样品条带之间的 安排也有问题,第二和第三道是重复的没必要浪费,而应该将第三道改为:将免 疫血清中的抗体先用抗原封闭,作为检测抗原特异性的对照。第四,蛋白条带不 均一,还diffused。坦率的说,这样的图若放在我们研究生的毕业论文中都不合 格,如果是同行拿这样的图来跟我做学术讨论,我会说,把结果做好了再来讨论, 免得浪费大家时间。而司教授是我国免疫病理和肿瘤免疫学界的知名前辈,又是 国家自然科学基金委的二审专家,似乎不可能将这样的结果就作为指控别人“造 假”(连作为学术争议都不够格)的证据之一吧?要知道NSFC被认为是国内最为 公正的基金部门,我们几乎每年都要花很多时间去写基金申请,若二审评委是这 样的水平和心态,我真的是无话可说,只感到悲哀。   我没想到自己会卷入这场争议中,十分感谢各位网友和方先生对我的耐心和 宽容。该说的在这几个帖子全说了,部分内容可能冒犯了一些网友,在这给您道 歉了。虽然我也许不会再写帖子了,但我仍会关注新语丝,我认为它是目前最好 的学术打假论坛,这其中有方先生的努力,更得益于各位网友的支持,希望我们 都能爱护她并为使她更上一层楼而努力。从新语丝上看,有些网友可能还是学生, 我愿就Western Blot写一些个人体会,来与你们交流,也算是答谢各位对我的宽 容吧(只供本科生和硕士研究生参考)。   就以司教授的脐带静脉内皮细胞为例:   1. 该细胞是原代培养细胞,因此,样本的来源,分离细胞的方法,培养条 件和细胞在体外传代的次数,等等均可显著影响该细胞的抗原表达(自然也会影 响以后的结果),因此,在不同的实验中(搞攻坚战,总需一段时间),要尽可 能使用相对一致的条件,这可显著提高结果的可重复性。   2. 抗原制备:选择全细胞抗原有很多因素要考虑(采用坏死、凋亡、还是 活细胞?凋亡和坏死的诱导方式和时间?裂解方式和采用的试剂;有无固定?固 定剂种类和处理时间等等均可影响免疫应答的pattern);若觉得太复杂,一般 可以选一种文献报道的先试一下(一般选较好的文献),根据结果再作调整。   3. 注射:途径,剂量,次数和间隔等等均可影响最终的应答结果。   4. 就Western blot本身,若第一次看不出样品之间的差别,不一定是真的 没差别,有可能是超过了检测的敏感度。包括样品量,转膜条件,一抗和二抗的 浓度与孵育时间,洗膜程序,曝光的时间选择等等,这些均可显著影响结果。胶 片是有一定的敏感范围的,需优化条件才能看到样品之间的差别。假如条带A和B 均很强,没差别,您可以通过减少loading的蛋白量,降低一抗的浓度和缩短曝 光时间等,来确认是否真的没有差异表达。判断结果时,有条带的是肯定的;而 没有条带,可能是表达量较低,不一定是完全没有。同样,若观察到样品之间的 差别,说明确有差别;而看不到差别时,不一定真的没差别。免疫组化也相似, 这可帮助我们了解蛋白的表达水平差异。同样,在曝光时,若你觉得你感兴趣的 蛋白信号很强,可以短时间曝光,这样图片质量就会好很多(当然,这样做其它 较弱的应答就看不出来了,我们一般放一张Overexposure帮助我们了解一下总的 应答,让自己心里有数;但发表时,一般选用较为干净的一张,条带少一些也没 关系,只要能说明你文章的问题就可)。   5. 从上面,我们明白有很多因素可以影响最终的图片。因此,千万不要把 一条带,一条带分别剪下来,再拼在一起。要同一张膜,若可能,最好在同一时 间使用同一批buffer准备所有样品,并跑在一块胶上。剪接和拼凑的图片,不能 说一定是造假,但至少可认为不严谨。因为,就算是同一张膜,同样的处理,单 纯的曝光时间不同或显影不同就可得出不同强度的条带。另外,万一实验重复不 出别人的结果,也不要贸然指责别人“造假”。记得王选先生当年搞汉字激光照 排,几乎没人相信。就此打住。再次谢谢各位花时间来读俺的帖子。祝各位心想 事成。   一只海龟   2006年4月19日 (XYS20060421) ◇◇新语丝(www.xys.org)(xys.dxiong.com)(xys.3322.org)(xys.xlogit.com)◇◇