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生物信息学要灭绝了么？

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有牛人狂言曰：生物信息学即死，读来哑然失笑。尽管我无法知道显示器后面坐
的到底是谁，甚至是什么，但是鉴于新语丝的影响力大，有必要对此说几句。以
下是原文：

“……唯一可以解释的是，她（按：指中科院遗传发育所最年轻的博导王秀杰）
所做的研究，所谓的生物信息学，虽然在美国已经被称为“就要绝种的学科”，
在中国，还是满热门的。”
——Cloudy Wood

首先，我不知道这个“在美国”是指美国的那一类团体。大约应该不会是基督教
社团，因为大多此类团体恨不得整个生物学现在就绝种。由于生物信息学是个很
专业的名词，姑且认为是科学界吧，可是科学界有“隔行如隔山”之说，比如我
一个学生物的就不敢说物理学如何如何；甚至在生物学这个框子里，我也不敢对
其他的专业多作评论，比如我以前学动物遗传育种，我就不敢说玉米育种即将死
亡。姑且认为这个“在美国”就是在美国的生物信息学界或者和生物信息学“交
叉”的学科吧。

那么什么是生物信息学呢？按Janet Thornton教授(1)的说法，生物信息学
（Bioinformatics)是：“the collection, archiving, organization and 
interpretation of biological data”。这个定义我个人认为内涵太少，按这
种说法，传统的动植物育种也要被包括进来了。但以下一些内容应当是生物信息
学界的共识。生物信息学兴起于 1990年代初期。当时随着人类及相关基因组计
划的启动，生物学家们如今要面对浩瀚的数据。生物信息学整理、组织和解释的
正是此类数据。也就是说：“…… 生物信息学家的工作不仅要提供工具和数据
库，我们还处于这样一个位置，那就是去问和回答有关分子进化、生物功能和生
物系统控制的根本性问题。”（1）。说到这里，我们不难看出，倘若生物信息
学即将灭绝，那生物学定然要死在前面。

说某某学科即将灭绝甚至已死，我倒不是第一次听说，甚至也有出自严肃科学家
之口。上个世纪八十年代末，很多搞数量遗传的断言：数量遗传学已死。这其中
也包括了很多杰出人士。环顾当今数量遗传学的火热，恍若隔世。

（1） C.A. Orengo, D.T. Jones & J.M. Thornton Bioinformatics--Genes, 
Proteins & Computers BIOS Scientific Publishers Limited, 2003 

(XYS20041101)

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