扁平上皮癌发生在肺部入口部分，研究表明与吸烟有直接的关系。不过扁平上皮癌只占肺癌全体的25～30%，该种类型的癌转移较慢，如果早期发现的话，治愈率可以达到很高。肺腺癌发生在肺末梢部，大概占男性肺癌的60％，调查表明肺腺癌与吸烟没有关系, 倒是与体内雌性激素的量和浓度很大关系，（据说是肺泡细胞上可能存在着雌性激素受体）。经期比较长的女性（初潮比较早，停经比较晚），发生肺腺癌的几率较高，这个是即使没有吸烟习惯的女性也会患上肺癌的一个原因（雌性激素对男性肺癌的影响还不明了）。另外由于是发生在肺部末梢，有推测是它可能与大气中的微小粒子状物质渗透到肺部深处有关。肺泡巨噬细胞在排除有害异物时产生大量活性氧，结果会使肺泡附近的正常细胞发癌几率增加。
另外，不管是什么癌都是由体内细胞在过度stress（如活性氧环境）下的基因突变引起的，有的人的基因对stress的耐受能力强，有的人的耐受能力相对较弱，这个大概是虽然环境相同，但癌症发生存在个体差异的原因吧。