医学科学的发展，是人类同疾病及影响健康的一切不利因素进行不间断斗争的经验总结和循序提高的过程，不断扩展探索领域以求相关进步的过程，因此，医学科学具有两个最为重要的特点，即继承性与系统性。中国医学特别中国传统医学的发展，除了上述两个特点外，由于其本身在近代遭到政治的干扰，未能实现其自身的现代化，其丰富的医疗经验和理论知识，仍然存在着重要的现实应用价值，即实用性。中国医学史理论研究的目的和意义，基本上是由上述继承性、系统性和现实的实用性决定的。恩格斯曾指出：“科学史就是把这种谬误逐渐消除，或是更换为新的，但终归是比较不荒诞的谬误历史”。中国医学史理论研究，正是要揭示中国医学在其发生、发展和进步的历程上，如何不断取得新的进步和成果，以为学科建设与现实的需要服务。因此，归纳起来，其目的和意义约有以下若干方面。

(1)通过研究揭示中国医学科学的特征，总结历史经验和探索其发展规律，为当代医学科学的发展道路、途径和方法，提供政策性借鉴。

(2)研究中国医学发展与历代社会制度、政治经济、哲学思想、宗教文化和科学技术的相互关系，分析研究揭示其诸种因素的相互影响，从而汲取其历史经验和教训，对制定和正确评价医药卫生工作的方针，一定会有较好的理论意义。

(3)通过对历代医学家科研方法的研究，分析其成功的或失败的思维方法、工作方法，总结其经验，揭示其存在的规律性，用以选择科研方向、制定科研规划，创造有利于科研课题的顺利进行发挥有益的启示和借鉴作用。

(4)对历代作出杰出贡献的医学家，研究其成长道路、治学态度、学术思想等，用以为当代的医学人才培养，出人才、出成果都会有一定的帮助。

(5)通过对中国医学科学技术的研究，特别是诊疗技术的创造发明史的研讨，讨论其历史作用和在国内、外的影响，振奋中华民族创造精神。

(6)国内、外医学交流，是医学科学发展的重要条件之一，中国先进的医学理论和医疗技术对国外曾有过巨大影响，国外先进的医学理论和医疗技术，也曾对中国医学的发展产主过巨大的作用。上述经验的总结在中国医学史研究上也有着不可忽视的意义。

(7)理论体系产生出错综复杂的情况。中国医学史是一门高度综合的学科，不但是医学本身各学科的高度综合，而且是医学与自然科学、社会科学的高度综合。因此，要了解和掌握其整体的本质，汲取其有益思想，就必须了解医学发展的全过程，这也是中国医学史研究的一项重要功能。任何一个学科的发展、进步、创新和新理论经验的突破，无不以前人的经验、成就作为起跑点，医学尤其是这样，任何一位有成就的医学家都不可能是在割断历史的情况下获得的。在当代，虽然医学史研究的广泛意义远未引起人们应有的重视，但是，中国医史学研究对发展中国医学，实现中国传统医学、现代医学现代化是不可缺少的重要学科，其存在的价值和意义是任何其他学科所不能取代的，正因为如此，国外专门研究中国医学史近年来出现了一个新的高潮。